Planning

Monday, May 13, 2019

Time Event  
09:30 - 10:00 Coffee break  
09:45 - 12:00 Workshop - Echanges entre éco-statisticiens et porteurs d’enjeux en biodiversité (2E06) - Jean-Yves Barnagaud & Thierry Chambert  
12:00 - 13:45 Lunch  
13:45 - 14:00 Introduction - Introduction  
14:00 - 16:00 Communautés, biodiversité et macro-écologie (2E07)  
14:00 - 14:15 › An ecologist's guide to infer drivers of community assembly using ABC - elizabeth barthelemy - Laboratoire dÉcologie Alpine  
14:15 - 14:30 › Uncovering ecological associations between species from their co-distribution - Sara Si-moussi - Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes, Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications, Laboratoire dÉcologie Alpine, Institut national d'études supérieures agronomiques de Montpellier  
14:30 - 14:45 › Caractérisation des modèles de biodiversité : approche par comparaison de formes de courbes  
14:45 - 15:00 › Clustering des données OTU par Modèle S.B.M. - Mohamed Anwar ABOUABDALLAH - I  
15:00 - 15:15 › The importance of being random! Taking full account of random effects in nonlinear sigmoid hierarchical Bayesian models - Ugoline Godeau - Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture - IRSTEA (FRANCE)  
15:15 - 15:30 › Can a megaherbivore affect where a top predator kill its prey in woody vegetation through modification of its structure? - Nicolas Ferry, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive  
15:30 - 15:45 › Les ravageurs et non les prédateurs, sont plus abondants dans les vergers-maraîchers que dans les monocultures de légumes  
16:00 - 16:30 Coffee break  
16:30 - 17:30 Landscape Ecology (2E07)  
16:30 - 16:45 › Stochastic geometry and graph-based modeling of agricultural landscapes: towards better understanding of population dynamics in biological control - Patrizia Zamberletti, Biostatistique et Processus Spatiaux  
16:45 - 17:00 › SILand : un package R pour estimer les effets multi-échelles des variables du paysage - Florence Carpentier, BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes, INRA - Mathématiques et Informatique Appliquées  
17:00 - 17:15 › Estimation of contact networks from air-mass movements. Application to the epidemio-surveillance of air-borne plant pathogens - Maria Choufany, Biostatistique et Processus Spatiaux  

Tuesday, May 14, 2019

Time Event  
09:00 - 11:00 Démographie et dynamique des populations (2E07)  
09:00 - 09:15 › Reviewing movement ecology: publications and R packages - Mathieu Basille, Department of Wildlife Ecology and Conservation, Fort Lauderdale Research and Education Center, University of Florida  
09:15 - 09:30 › Quand partir d'un site de halte migratoire? Utilisation d'une covariable individuelle partiellement observable pour expliquer les décisions des passereaux migrateurs - Sébastien Roques, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive, Evolution et Diversité Biologique  
09:30 - 09:45 › Fitting stochastic predator-prey models using both population count and attack rate data - Frederic Barraquand, Integrative and Theoretical Ecology Chair, Labex COTE, Institut de Mathématiques de Bordeaux  
09:45 - 10:00 › Un cadre HMM spatial pour modéliser la dynamique d'espèces avec stade de dormance - Nathalie Peyrard, MIAT- INRA  
10:00 - 10:15 › A mechanistic-statistical species distribution model to explain and forecast wolf (Canis lupus) colonization in South-Eastern France - Julie Louvrier, Centre d'écologie fonctionnelle et évolutive  
10:15 - 10:30 › Caractérisation des co-occurences d‘espèces dans les captures des pêcheurs pour améliorer l'estimation des rejets de pêche - Stéphanie Mahévas, Ecologie et Modèles pour l'Halieutique  
10:30 - 10:45 › Comment analyser la distribution spatiale d'un cortège avifaunistique dans un habitat fluctuant dans le temps et l'espace ? - Paméla Lagrange, Observatoire du patrimoine naturel littoral de Réserves Naturelles de France  
10:45 - 11:00 › Exemple de difficulté d'estimation de modèle hiérarchique et de solution : cas d'un modèle non-linéaire hiérarchique - Frédéric Gosselin, Ecosystèmes forestiers  
11:00 - 11:30 Coffee break  
11:30 - 12:30 Epidémiologie (2E07)  
11:30 - 11:45 › Model&data-based prediction of invasive species dynamics - Focus on Xylella fastidiosa - Candy Abboud, Biostatistique et Processus Spatiaux  
11:45 - 12:00 › Identifying lookouts for epidemio-surveillance: application to the emergence of Xylella fastidiosa in France - Davide Martinetti, UR BioSP INRA Avignon  
12:00 - 12:15 › A statistical learning approach to infer transmissionsof infectious diseases from deep sequencing data - Maryam Alamil, Biostatistique et Processus Spatiaux  
12:30 - 13:45 Lunch  
13:45 - 14:30 Big-data (2E07)  
13:45 - 14:00 › Quelle stratégie BIG DATA pour la biodiversité ? - didier Mauuary, BLUEBAT  
14:00 - 14:15 › Vers une eco-régionalisation à haute résolution des façades marines françaises : un exemple de partitionnement non-supervisé appliqué à des couches océanographiques de nouvelle génération - Fernando Tempera, IFREMER/RBE/STH - Mickaël VASQUEZ, Ifremer - Dynamiques de l'environnement côtier - Matthieu Caillaud, IFREMER - Centre de Brest  
14:15 - 14:30 › Vision par ordinateur pour la reconnaissance individuelle de girafes de la Zone Atelier Hwange - Vincent MIELE, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive  
14:30 - 15:00 Discussion image processing (2E07)  
15:00 - 15:30 Coffee break  
15:30 - 16:30 Sciences participatives (2E07)  
15:30 - 15:45 › Galaxy-E : Une plateforme d'analyse de données accessible. - Simon Benateau, CESCO  
15:45 - 16:00 › CAPITALIZING ON OPPORTUNISTIC DATA TO REFINE BIRD POPULATION TREND ESTIMATES - Karine Princé, University of Wisconsin-Madison [Madison], Muséum National d\'Histoire Naturelle, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive  
16:00 - 16:15 › Interactions entre gestionnaires d'espaces naturels et éco-statisticiens : exemple d'une étude sur l'avifaune des salins d'Hyères, Réserve Naturelle de Port-Cros - Jean-Yves Barnagaud, Centre d'Ecologie Fonctionnelle et Evolutive – UMR 5175 CEFE, CNRS, PSL Research University, EPHE, University of Montpellier, SupAgro, IND, INRA  
16:15 - 16:30 › Analyses de données avifaunes disponibles sur les Salins d'Hyères : l'apport des statistiques pour tirer parti d'un jeu de données incomplètement exploité par les gestionnaires - David Geoffroy, PN Port Cros  
16:30 - 17:00 Discussion (2E07)  
  
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